Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samd12Q0VE29 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms