Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms