Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 435.1 ms