Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms