Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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