Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms