Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms