Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pabpc1P29341 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pabpc1P29341 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pabpc1P29341 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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