Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms