Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms