Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms