Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms