Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms