Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr16A3KMN5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr16A3KMN5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr16A3KMN5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr16A3KMN5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr16A3KMN5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr16A3KMN5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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