Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms