Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms