Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb4A2A863 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms