Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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