Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PrameQ9D4Z5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PrameQ9D4Z5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PrameQ9D4Z5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PrameQ9D4Z5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PrameQ9D4Z5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PrameQ9D4Z5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PrameQ9D4Z5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PrameQ9D4Z5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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