Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms