Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pin4Q9CWW6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pin4Q9CWW6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms