Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Prpf8Q99PV0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms