Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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