Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkn3Q8K045 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms