Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vwc2Q8C8N3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms