Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms