Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms