Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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H2-M10.6Q85ZW5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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