Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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