Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Krt77Q6IFZ6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Krt77Q6IFZ6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Krt77Q6IFZ6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Krt77Q6IFZ6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Krt77Q6IFZ6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Krt77Q6IFZ6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krt77Q6IFZ6 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Krt77Q6IFZ6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Krt77Q6IFZ6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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