Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

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Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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