Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Herc2Q4U2R1 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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