Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms