Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Dtx3lQ3UIR3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dtx3lQ3UIR3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms