Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms