Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms