Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnma1Q08460 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms