Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm2707-201ENSMUST00000188979 714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Myl1-201ENSMUST00000027151 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 4931417E11Rik-201ENSMUST00000070163 1095 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Scgb2b26-201ENSMUST00000085623 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms