Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Msx2Q03358 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms