Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gja5Q01231 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms