Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms