Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms