Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms