Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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