Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cbx1P83917 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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