Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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PtpreP49446 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtpreP49446 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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