Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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TtlP38585 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms