Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UbbP0CG49 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms