Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LtaP09225 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
LtaP09225 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LtaP09225 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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