Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf13O54965 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf13O54965 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf13O54965 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf13O54965 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf13O54965 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf13O54965 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf13O54965 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf13O54965 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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